Untuk mengejar mimpinya dengan kemampuan sekolah dasar terbaiknya, Tsubasa pindah bersama ibunya ke kota Nankatsu, yang terkenal dengan tim sepak bola sekolah dasar yang sangat baik.
Tsubasa Oozora yang berusia 11 tahun mulai bermain sepak bola pada usia yang sangat muda, dan sementara itu kebanyakan hanya olahraga rekreasi untuk teman-temannya, baginya, itu berkembang menjadi semacam obsesi. Kapten Tsubasa adalah kisah penuh gairah dari seorang siswa sekolah dasar yang pikiran dan mimpinya berputar hampir seluruhnya di sekitar cinta sepak bola.